精准农业与智能装备技术方向，实验室重点发展田间信息精确获取与诊断技术，以及通用作业和装备集成技术，旨在实现小农场低成本的精准管理。在农业生物与环境控制技术上，实验室关注设施农业的智能化管理，包括生物传感器技术、环境信息采集和远程调控技术，以及节水控制技术，以优化农业生产环境。
农业部农业信息技术重点开放实验室源于北京农业信息技术研究中心，这个实验室于2002年11月经农业部评估并被正式命名为重点开放实验室。在2008年，实验室成功进行了第二轮的重点开放实验室命名，彰显了其在农业信息化领域的权威地位。
农业部设施农业工程重点开放实验室的使命在于探索和应用农业生物与环境因素以及工程设施之间的相互作用规律。实验室的核心工作是进行基础研究，旨在发展高效、现代化的设施农业环境调控技术，并推动我国农业生物环境与能源工程学科的创新发展。
农业部生物技术与作物品质改良重点开放实验室的主要研究方向集中在探索作物品质性状形成背后的科学原理以及其调控机制。这一领域旨在深入理解影响作物品质的关键因素，以便于更有效地管理和提升农作物的品质特性。实验室着重于作物品质相关基因的定位、克隆和功能验证工作。
1、农业部市场与经济信息司承担着制定和实施农产品市场相关法规的重要职责，负责构建农产品和农业生产资料的市场体系，包括规划、计划的拟定与执行。其政策建议聚焦于农产品供求、流通及价格，致力于推动农产品流通的健康发展。
2、承担提升农产品质量安全水平的责任 依法开展农产品质量安全风险评估，发布有关农产品质量安全状况信息，负责农产品质量安全监测。提出技术性贸易措施的建议。制订农业转基因生物安全评价标准和技术规范。参与制订农产品质量安全国家标准并会同有关部门组织实施。指导农业检验检测体系建设和机构考核。
3、对于农村集体资产，司负责研究和制定管理法规，指导集体资产管理、产权制度改革，以及财务、审计监督和村级债权债务的清理化解工作。同时，他们也指导农民专业合作社的财务会计工作。农业产业化经营和农民专业合作组织的发展也是司的重要职责，他们会研究并提出相应的政策措施，指导这些组织的建设和健康发展。
4、执行国家有关工业和信息化工作的方针政策和法律、法规、规章，拟订工业和信息化的发展规划并组织实施。 拟订工业行业发展的中长期规划和年度计划，监测、分析国民经济运行态势，编制并组织实施近期经济运行调控目标，协调解决经济运行中的重大问题并提出意见和建议，分析和发布经济信息。
5、农业部产业政策与法规司的主要职责集中在制定和研究农业产业政策上，它的首要任务是开展深入的农业产业政策研究，草拟相应的政策，并对农业产业的安全和发展问题进行探究，以提出保障和推动农业产业发展的政策建议。
6、- 负责农场和国际贸易的机构有两个：新设立的农场服务署，承担原农业稳定和保持局、农场主家庭管理局、联邦农作物保险公司等机构的职能；国外农业局，负责农产品出口、出口信贷保证、对外农业援助和多边贸易协定的实施。商品信贷公司一直属于农业部，对稳定国内农业生产和市场发挥了重要作用。
1、农业部渔政指挥中心的内设机构分工明确，旨在高效管理与执行各项职责。首先，办公室（财务处）作为中心的行政核心，协助领导处理日常政务，包括文件起草、规章制度制定和实施、文件管理、工作规划协调以及财务和固定资产的管理。它还负责人事、保密、安全事务，以及党群组织工作的支持。
2、农业部乡镇企业发展中心内设机构包括办公室、财务处、新农村建设处、社区环境处、休闲农业处、产业服务处以及职业技能鉴定指导处等，各处室职责如下：办公室负责中心的日常管理，包括内部组织协调、规章制度制定、会议组织、综合材料撰写、公文处理、党务人事、资产管理、机要保密等工作，并与乡企协会保持联络。
3、农业部农产品质量安全中心内设办公室、审核处、监督处、技术处、地理标志处五个职能部门，下设种植业分中心、畜牧业分中心和渔业分中心。
4、中监所内设机构21个，其中：综合、业务管理部门8个，技术支持部门9个。全所现有工作人员272人，其中具有高级技术职称的78人，具有博士、硕士学位的90人。
5、农业局内设二级机构有以下十二个：办公室、政策法规科、计划财务科、农村经济体制与经营管理科、市场与经济信息科、科技教育科、种植业管理科、农业机械化管理办公室、畜牧兽医办公室、农业综合开发办公室、人事科、扶贫开发领导小组办公室。